Im März 2003 musste Wagner seine Redaktionstätigkeit aus gesundheitlichen Gründen aufgeben.
Danach zog er sich völlig aus der Öffentlichkeit zurück.
In jenen Jahren aber arbeitete er den Schmalkalder Stasi-Sturm im Dezember 1989 geschichtlich auf; und sein Film „Aufruhr im Advent“, der im Jahre 2009 uraufgeführt wurde, stieß auch überregional auf reges Interesse.
Nach der dokumentarischen Aufarbeitung eines heimatgeschichtlich-bedeutsamen Ereignisses besann sich Wagner der Lyrik seiner frühen Jahre, und es erschien 2011 die Textsammlung „Traumbeladen“, die Gedichte und Essay enthält.
Ab diesem Zeitpunkt widmet sich Wagner nur noch der schriftstellerischen Arbeit, und zwischen 2012 und 2019 entsteht der Roman „Leben ohne Maske“ .
Wagner lebt in Asbach bei Schmalkalden.